1、結構上：兩箱式冷熱沖擊箱只有高溫區(qū)和低溫區(qū)，而三箱式冷熱沖擊箱多了一個測試區(qū)。

2、測試過程上：兩箱式冷熱沖擊箱它的“測試區(qū)"是一個吊籃，裝載測試樣品在高溫區(qū)和低溫區(qū)之間移動，轉換時間只有10秒，能更好的模擬瞬時的溫度轉換沖擊，吊籃轉換到一個溫區(qū)后，因轉換前吊籃帶有另一溫區(qū)的能量。所以控制系統(tǒng)會啟動加熱或制冷來增加熱量或者冷量的補充讓溫度穩(wěn)定。

三箱式冷熱沖擊箱的樣品放在測試區(qū)，不能移動。要做高溫沖擊就把高溫區(qū)與測試區(qū)的循環(huán)風道打開，其他關閉；要做低溫沖擊就把低溫區(qū)與測試區(qū)的循環(huán)風道打開，其他關閉。剛做完高溫沖擊，必須經歷一段常溫沖擊，就是要先關閉高溫區(qū)與測試區(qū)的風道門，把測試區(qū)的與箱體外的風道打開，一個抽出，一個抽進。溫度穩(wěn)定后，如需做完整的常溫沖擊，這時就把溫度再恒定一段時間。如果不用做完整的常溫沖擊，這時馬上把測試區(qū)的與箱體外的風道關閉，接著把低溫區(qū)跟測試區(qū)的風道打開，進行低溫沖擊。反過來，也是一樣。

3、性能上：三箱式冷熱沖擊箱，高低溫沖擊間，必有排熱氣或冷氣先到常溫的過渡段。樣品不用打開箱門就可以做常溫沖擊。但兩箱式的不用經歷這個過渡，轉換的時間也更快，沖擊的溫差也可以更大，均勻度也更好，穩(wěn)定時間也更短。只是因為吊籃不斷在冷熱環(huán)境中轉換，整個傳動系統(tǒng)也一樣經歷冷熱環(huán)境的考驗，壽命也比三箱的短。